Épigénétique

Présentation

 

« L'épigénétique est l'étude des changements d'activité des gènes — donc des changements de caractères — qui sont transmis au fil des divisions cellulaires ou des générations, sans faire appel à des mutations de l'ADN¹⁰. »

Par exemple, une même larve d'abeille deviendra une reine ou une ouvrière en fonction de la façon dont elle est nourrie¹¹, et un même œuf de tortue peut éclore en mâle ou femelle en fonction de la température¹². Il s'agit bien de l’expression du même code génétique global, mais des facteurs environnementaux ont sélectionné une expression plutôt qu'une autre, chacune étant disponible dans la « base de données » génétique.

Autrement dit, l'épigénétique concerne l'ensemble des mécanismes qui gouvernent la façon dont le génotype est utilisé pour créer un phénotype.

Principe

Par analogie, on peut rapprocher le couple génétique - épigénétique à l'écriture et à la lecture d'un livre.

« On peut sans doute comparer la distinction entre la génétique et l'épigénétique à la différence entre l'écriture d'un livre et sa lecture. Une fois que le livre est écrit, le texte (les gènes ou l'information stockée sous forme d'ADN) sera le même dans tous les exemplaires distribués au public. Cependant, chaque lecteur d'un livre donné aura une interprétation légèrement différente de l'histoire, qui suscitera en lui des émotions et des projections personnelles au fil des chapitres. D'une manière très comparable, l'épigénétique permettrait plusieurs lectures d'une matrice fixe (le livre ou le code génétique), donnant lieu à diverses interprétations, selon les conditions dans lesquelles on interroge cette matrice¹³. »

S'il existe une « base de données génétique », sa lecture s'effectue de façon éminemment diverse en fonction des modifications épigénétiques qui sont apportées au génome et à la chromatine. La transmission de l'héritage génétique s'accompagne également de celle d'un héritage épigénétique.

Mise en évidence

« Si les caractères de l'individu sont déterminés par les gènes, pourquoi toutes les cellules d'un organisme ne sont-elles pas identiques¹⁴ ? »

Cette interrogation de Thomas Morgan qui se rapporte aux organismes pluricellulaires impose le constat de différences possibles dans l'expression d'un même génome car les cellules d'un même organisme — ou cellules somatiques — sont génétiquement identiques, clones les unes des autres. Sauf cas exceptionnel de mutation spontanée ou lors du développement des lymphocytes T, les cellules issues d'une seule cellule œuf et dupliquées par mitose partagent exactement le même patrimoine génétique. Pourtant un neurone, un globule blanc, ou encore une cellule épithéliale sont très différentes les unes des autres. « Cadre classique de l'épigénétique »¹⁰, cette différenciation cellulaire sur la base d'un même code génétique est un objet d'étude de la biologie du développement.

L'existence de phénomènes épigénétiques se trouve également illustrée par les différences physiques et biologiques constatées chez des animaux de laboratoire clonés¹⁵, ou chez les clones naturels que sont les vrais jumeaux (monozygotes) chez qui les empreintes épigénétiques sont beaucoup plus semblables à 3 ans qu'à 50 ans¹⁶. Une vaste étude est toujours en cours pour caractériser les différences entre jumeaux monozygotes¹⁷.

Si ces mises en évidence concernent principalement des êtres pluricellulaires eucaryotes, des phénomènes épigénétiques ont aussi été mis en évidence chez des êtres unicellulaires aussi bien eucaryotes (par exemple la levure)¹⁸ que procaryotes¹⁹.

Histoire

 

« […] le terme [épigénétique] a été introduit à plusieurs reprises dans l'histoire de la biologie, avec à chaque fois un sens différent⁵. »

L'histoire de l'épigénétique peut se rapporter aux théories qui se demandent si la totalité des caractéristiques d'un individu est contenue dans l'œuf dont il est issu, aux théories de l'influence du contexte sur la génétique, ou encore à la mise en évidence moléculaire de ces mécanismes et de la réversibilité sur quelques générations d'un caractère, en particulier s'il est créé par l'environnement.

Par ailleurs, le terme ou des formes dérivées, telle que « épigénisation »^{N 1}, sont également utilisés dans d'autres disciplines, par exemple la géologie.

Épigenèse

Le mot épigenèse remonte à Aristote qui nommait ainsi le développement d'un œuf informe de façon graduelle aboutissant à un organisme aux tissus différenciés. Cette théorie s'opposa au préformationnisme dont les tenants qui se réclamaient d'Hippocrate postulaient que l'être vivant préexistait en miniature dans le germe²¹. La théorie de l'épigenèse fut soutenue par l'embryologiste William Harvey qui postulait en 1651 dans son ouvrage intitulé Exercitationes de generatione animalium que « tout ce qui vit vient initialement d'un œuf²²». À la même époque, la théorie préformationniste (ou préformiste) avait l'appui de Marcello Malpighi tandis que Nicolas Hartsoeker n’était pas préformiste, mais disséminationniste (hypothèse selon laquelle les germes des animaux sont incréés et dispersés à travers le monde)²³. Le débat entre épigénisme et préformationnisme fut une controverse majeure de la biologie au cours des siècles suivants, à travers notamment l'ovisme et l'animalculisme. Elle prendra fin au milieu du XIX^e siècle avec le développement de la théorie cellulaire et du rôle de la cellule, déjà envisagée par Buffon dans son Histoire naturelle générale et particulière²⁴.

À cette époque, Bénédict Augustin Morel propose une théorie de la dégénérescence en 1857, expliquant que le « crétin des Alpes » était le dernier rejeton d’une longue lignée d'individus de plus en plus dégénérés, rejetant l'hypothèse d'un manque d'iode, pourtant confirmée depuis²⁵.

Émergence de l'épigénétique

 

L'hypothèse de changements épigénétiques affectant l'expression des chromosomes a été émise par le biologiste russe Nikolaï Koltsov²⁸. On attribue la paternité de l'épigénétique dans son sens moderne au biologiste et embryologiste Conrad Hal Waddington qui la définit en 1942²⁹ comme une branche de la biologie étudiant les implications entre les systèmes gènes + environnement et leurs produits donnant naissance au phénotype d'un individu. Cette idée venait combler des lacunes du modèle génétique postulant une équivalence unique entre phénotype et génotype qui ne pouvait expliquer tous les phénomènes liés à la différenciation cellulaire^{N 2}. Il fut alors élaboré une théorie dans laquelle chaque cellule indifférenciée passait par un état critique qui serait responsable de son développement futur non uniquement lié à ses gènes, et pour cette raison qualifié d'épigénétique.

Dans les années 1960 et 1970, les expérimentations en biologie moléculaire fleurissent et donnent lieu à des Prix Nobel. En 1965, pour François Jacob, Jacques Monod et André Lwoff, qui mettent en évidence le rôle de l'ARN dans le contrôle génétique des synthèses enzymatiques et virales³⁰ ; en 1975, pour David Baltimore et Howard Temin, qui mettent en évidence le phénomène de transcription inverse, la synthèse d'un brin d'ADN à partir d'une matrice ARN³¹. Ces mécanismes annexes à la génétique sont fondamentaux dans la compréhension et l'émergence de l'épigénétique, mais ils ne remettent pas en cause le modèle standard de compréhension de l'évolution, la théorie synthétique de l'évolution, où seuls le hasard des mutations génétiques et la sélection naturelle sont en cause.

Cette certitude scientifique reste inébranlable jusque dans les années 1990 pendant lesquelles cette théorie synthétique est confrontée au séquençage complet de plusieurs génomes ce qui suggère qu'elle doit être complétée, car la communauté scientifique n'y découvre pas la totalité des effets phénotypiques dont elle espérait l'explication. Cette difficulté inattendue remet au goût du jour la recherche de facteurs externes au génome³². L'épigénétique ainsi redéfinie revendique alors sa place comme prolongement et complément de la génétique classique, notamment dans le domaine de la nutrition³³, de la reproduction³⁴, et comme « aspect de la post-génomique » accompagnant la recherche dans son passage de l'étude du génome à celui de l'épigénome³⁵.

Dans les années 1980, Robin Holliday (en) nomme « hérédité épigénétique »³⁶ l'hérédité mise en évidence chez les mammifères en 1999 par Emma Whitelaw (en)³⁷. L'étape suivante qui se développe depuis les années 2000 est le travail sur le rôle de facteurs environnementaux sur l'expression génétique, comme en 2007 avec l'exposition au bisphénol A qui perturbe la méthylation de l'ADN de souris³⁷. On étudie alors la possibilité de transmission des caractères acquis et le rôle des gamètes pour savoir s'ils peuvent conserver certains des marqueurs épigénétiques³⁸.

Souvent polémique parce que non prévue par la théorie synthétique de l'évolution (bien que son principe ait été suggéré par Lamarck hors de toute connaissance génétique, et que Darwin lui-même laisse ouverte explicitement dans L'Origine des espèces la possibilité chez les chiens pointers d'effets cumulatifs du dressage), mais surtout parce que prises à tort par le grand public pour une réfutation de l'existant plutôt qu'un complément, ces études accordent volontiers à l'épigénétique un rôle davantage marginal pour expliquer quelques mécanismes d'adaptation et d'évolution des formes vivantes⁶.

D'autres dimensions du rôle de l'épigénétique sont aussi explorées comme son incidence sur les neurones pour stabiliser leurs connexions synaptiques, ce qui aurait un rôle sur la mémoire à long terme³⁹ ; ou l'effet d'un stress infantile sur la sensibilité au stress à l'âge adulte par son effet sur la méthylation de l'ADN des récepteurs au glucocorticoïde⁴⁰.

Codage épigénétique et évolution

 

L'épigénétique propose des explications au sujet de la transmission des caractères acquis⁶.

La sélection naturelle combinée à la génétique et au hasard des mutations étaient les seuls facteurs reconnus de l'évolution depuis August Weismann, et jusqu'à l'apparition de l'épigénétique dans les années 1990. Pourtant l'idée de la possibilité de transmettre des caractères acquis est abordée entre autres par Aristote, Jean-Baptiste de Lamarck, Charles Darwin, ou encore Ivan Mitchourine et Lyssenko.

Les caractères épigénétiques ne s'opposent pas aux théories génétiques associées à la sélection naturelle, mais les complètent. Ainsi, l'hérédité épigénétique « présente une plus grande sensibilité à l'environnement et une stabilité inférieure à celle des modifications de la séquence de l'ADN »⁴³.

Selon Jean-Claude Ameisen qui vulgarise le sujet⁶, les expérimentations scientifiques dans le domaine se sont multipliées dans les années 2000 et 2010. Par exemple sur la transmission de caractères provoqués par le contexte, comme la présence d'une odeur^26,44 ou un vécu traumatique. Chez la souris par exemple, un trauma précoce semble avoir des répercussions comportementales et métaboliques sur les générations suivantes, y compris si les descendants n'ont jamais été mis en contact avec les parents (fécondation in vitro et « mère porteuse »)⁴⁵. Globalement l'étude de ce qui est transmis par les cellules séminales paternelles est utilisée afin d'isoler des caractères exclusivement innés^46,47.

On a récemment montré (2017) chez le rat de laboratoire que l'exposition d'une mère à de l'atrazine (désherbant) au moment de la formation des gonades de ses embryons faisait que cette molécule (ou le stress induit in utero par cette molécule) pouvait reprogrammer durablement des cellules souches gonadique et être source de problèmes épigénétiques dans les générations suivantes (susceptibilité aux maladies induites par l'atrazine, chez les mâles et les femelles)⁴⁸.

De même, une chimiothérapie subie par un adolescent semble induire des effets épigénétiques (transmis donc à la descendance) via une modification qualitative du sperme (anomalies de l'ADN)⁴⁹. C'est la 1^re démonstration du fait qu'une exposition chimique précoce peut reprogrammer durablement l'épigénome des cellules souches spermatogènes. Les épimutations de la lignée germinale (cellules du sperme) identifiées suggèrent que la chimiothérapie peut changer l'hérédité épigénétique à la génération suivante⁴⁹.

Mécanismes

Le problème de la différenciation cellulaire (des cellules différentes ayant toutes le même génome) a trouvé son expression moléculaire lorsqu'il est apparu que les mêmes gènes n'étaient pas exprimés d'un type cellulaire à l'autre. Ainsi, la combinaison de gènes nécessaires et suffisants à spécifier un type cellulaire donné est en général exprimée exclusivement dans ce type cellulaire. Dans de nombreux cas, ces gènes restent exprimés tout au long de la vie du lignage cellulaire (l'ensemble des divisions au sein d'un même type cellulaire). Il est donc important de comprendre comment se mettent en place ces spécificités cellulaires (comment les gènes deviennent activés ou réprimés au cours du développement) mais également, comment cette expression est par la suite propagée au cours des divisions cellulaires (par exemple pour maintenir l'expression de gènes spécifiques de l'identité musculaire dans des cellules de muscle). Une grande partie des recherches en épigénétique se concentre justement sur les mécanismes de propagation temporelle de l'expression des gènes, plus particulièrement sur la transcription qui constitue le premier niveau de régulation de l'expression des gènes. En effet, même si l'expression des gènes peut être régulée à plusieurs niveaux (transcription, épissage, export nucléaire des ARNs, traduction, etc.) la transcription semble être le principal niveau de contrôle. L'état « épigénétique » d'une cellule semble dépendre principalement de deux variables: 1- les régulateurs transcriptionnels présents (par exemple, les facteurs de transcription) et 2- l'état de compaction de l'ADN, qui va déterminer la capacité des régulateurs transcriptionnels à moduler l'expression des gènes. En résumé, la question posée en épigénétique consiste à comprendre comment, à partir d'un même génome, peuvent se mettre en place et se propager au cours de divisions cellulaires des états transcriptionnels (exprimé versus non exprimé) distincts.

Transcription de l'ADN en ARN

 

La transcription est la copie du code génétique de l'ADN en ARN. La double hélice de l'ADN est ouverte et une chaîne d'ARN complémentaire de l'ADN matrice est formée par le complexe de l'ARN polymérase II. Dans le cas des gènes dits « codants » (c'est-à-dire qui codent des protéines), cet ARN messager sert de matrice à la synthèse de protéines lors de l'étape de traduction. De nombreux gènes codent des protéines régulatrices appelées facteurs de transcription, dont la fonction est de moduler l'expression d'autres gènes.

Boucles d'autorégulation

 

Certains facteurs de transcription comme HNF4 et MyoD sont susceptibles d'activer leur propre expression, engendrant ainsi une boucle dite d'autorégulation⁵⁰. Ce mécanisme par autorégulation permet la persistance temporelle de l'expression des gènes après que le stimulus déclencheur ait cessé d'opérer. Notamment, après la division cellulaire par méiose ou mitose, si le stimulus à l'origine de l'activation d'un gène est absent, les cellules filles peuvent hériter de cette activation (par exemple par la présence de ces facteurs de transcription). Une telle régulation qui opère en trans, est retrouvée chez des procaryotes (exemple du phage Lambda⁵¹) comme chez les eucaryotes. Chez les eucaryotes multicellulaires, ce mécanisme « trans-épigénétique » par autorégulation concerne de nombreux facteurs de transcription impliqués dans la spécification de l'identité cellulaire, et est à ce titre un mécanisme épigénétique majeur.

Structure de la chromatine

 

La chromatine des eucaryotes, association entre l'ADN et les protéines histones, autour desquelles l'ADN s'enroule en bobine, constitue une couche régulatrice supplémentaire au contrôle de l'expression des gènes. Celle-ci peut être soit décondensée ou « ouverte » (euchromatine), permettant ainsi l'accès à la machinerie transcriptionnelle et à l'expression génique, soit condensée ou « fermée » (hétérochromatine), empêchant ainsi l'expression d'un gène.

Certaines régions du génome sont constamment dans un état chromatinien fermé, on parle d'hétérochromatine constitutive. C'est ainsi le cas des centromères et des télomères.

L'état de la chromatine dépend de plusieurs facteurs qui régulent sa structure en modifiant chimiquement l'ADN ou l'état post-traductionnel des protéines d'histones ou l'action de remodeleurs de la chromatine et de protéines chaperons.

Plusieurs mécanismes de propagation épigénétique de l'information utilisant des modifications de la chromatine se sont mis en place chez les eucaryotes.

L'état des histones

Les histones forment la « bobine » autour de laquelle vient s'enrouler l'ADN. Chaque boucle d'ADN avec autour d'un complexe de 8 histones forme un nucléosome. Ces protéines histones sont elles-mêmes sujettes à plusieurs modifications post-traductionnelles que l'on retrouve principalement sur leurs queues N-terminales qui dépassent de la structure du nucléosome :

• La méthylation : la présence du groupe méthyle au niveau de résidus lysines peut être associée à un état chromatinien répressif, c'est le cas par exemple des tri-méthylations sur les lysines 9 et 27 de l'Histone H3 (H3K9me3 et H3K27me3). La méthylation d'autres résidus est elle associée à un état ouvert de la chromatine telle la tri-méthylation de la lysine 4 de l'histone H3 (H3K4me3) qui est retrouvée au niveau des promoteurs de gènes exprimés ou encore la tri-méthylation de la lysine 36 de l'histone H3 (H3K36me3) qui est présente le long de la région transcrite des gènes.
• L'acétylation : l'acétylation des lysines diminue la charge (positive) des histones, diminuant ainsi l'interaction avec l'ADN chargé négativement. Cette modification entraine donc une ouverture de la chromatine, permettant ainsi la transcription.
• D'autres modifications peuvent être observées sur les histones et peuvent influer sur l'état d'ouverture de la chromatine, parmi elles la phosphorylation ou encore l'ubiquitination et la sumoylation.

Les modifications d'histones sont régulées par des enzymes spécialisées qui peuvent soit catalyser leur déposition (activité dite d'écriture) ou leur effacement (activité dite d'effacement). Les modifications post-traductionnelles des histones peuvent influencer la chromatine de différentes manières : modification de la charge des histones (comme dans le cas de l'acétylation), modification de la structure de la chromatine, ou signal permettant le recrutement de protéines régulatrices (appelées « lecteurs » de la chromatine). De plus, il existe des régulations croisées très importantes entre les différentes modifications de la chromatine. Par exemple, certaines modifications d'histones inhibent l'activité d'enzymes qui catalysent la déposition d'autres modifications⁵².

Les modifications d'histones sont souvent abusivement qualifiées d'épigénétiques. En réalité la plupart des modifications d'histones sont directement contrôlées par la transcription et participent à la robustesse plutôt qu'à la propagation des états transcriptionnels des gènes⁵³.

Méthylation de l'ADN

L'expression d'un gène peut également être régulée par une modification chimique de l'ADN : la méthylation ; précisément la méthylation de cytosine en 5-méthylcytosine des paires de base (ou dimères) C-G⁵⁴.

Cette méthylation peut inhiber l'expression génétique d'un brin d'ADN : une faible méthylation se traduit le plus souvent par une forte expression du gène, alors qu'un haut niveau de méthylation inactive le gène. Cependant, il existe des exemples où une forte méthylation n'a pas de répercussions sur le niveau d'expression.

Chez l'être humain, la méthylation de l'ADN s'effectue au niveau des résidus cytosines des îlots CpG (en), site CpG qui se trouvent essentiellement dans les régions proximales des promoteurs de 60 % des gènes. Dans les cellules normales, ces îlots sont non méthylés, une petite portion devient méthylée pendant le développement, rendant ainsi quelques gènes silencieux de manière stable.

On a longtemps pensé que la présence d'un groupe méthyle N1 sur des bases adénine de l'ADN et de l'ARN était une forme de dommage de l'ADN, mais des travaux récents (2016) indiquent que cette méthylation survient aussi dans des sites spécifiques des ARN messagers, où il affecte l'expression des protéines⁵⁵.

L'empreinte parentale

Lors de la division cellulaire (mitose), un gène peut être transmis avec état de méthylation de l'ADN qui le porte, comme on peut donner un livre avec des marque-pages, mais on considère généralement que pour la reproduction (méiose et fécondation), il y a un nettoyage de tout marquage épigénétique pour permettre le développement d'un nouvel individu.

« Or, des travaux réalisés sur la souris ont récemment révélé [2013-2014] que les brins d'ADN portés par les gamètes (spermatozoïdes et ovules) ne sont pas totalement « vierges » de ces molécules de transcription⁵⁶ ! »

La méthylation de l'ADN est l'acteur majeur de la mise en place de l'empreinte parentale, mécanisme par lequel l'expression d'un gène va dépendre de l'origine parentale. Par exemple, dans le cas d'un gène à expression maternelle, l'allèle paternel est méthylé et entièrement éteint alors que l'allèle maternel est non méthylé et entièrement exprimé. L'empreinte parentale dépend également des modifications de la chromatine⁵⁷. La méthylation de l'ADN est également souvent observée dans les gènes répétés et les rétrotransposons et pourrait être un mécanisme naturel pour l'inactivation des gènes inutiles et potentiellement délétères s'ils étaient exprimés⁵⁸. Les méthylations de l'ADN peuvent soit être héritées, soit créées ou modifiées en réponse à un facteur environnemental.

Inactivation du chromosome X chez les mammifères femelles

L'inactivation du chromosome X, est un processus à partir duquel un des deux chromosomes X de la femelle mammifère est inactivé, ce qui permet de compenser la double dose de gènes de ce chromosome par rapport aux mâles. Le chromosome X inactif est fortement hétérochromatinisé et prend une forme compacte visible dans le noyau des cellules, connue sous le nom de corpuscule de Barr. Par conséquent une majorité des gènes du chromosome X inactif n'est plus exprimée. Le choix du chromosome X à inactiver se fait au hasard pendant le développement embryonnaire précoce. L'état inactif du chromosome X est ensuite fidèlement transmis à la descendance des cellules dans lesquelles le choix a été effectué. On est donc bien en présence d'un phénomène épigénétique puisque coexistent au sein d'une même cellule deux chromosomes dans des états différents et que ces états sont propagés au fil des divisions cellulaires.

Méthylation globale

Il existe une interdépendance entre la méthylation de l'ADN et celle des histones : on a montré une interaction entre certaines protéines à activité de méthylation de l'ADN, et un système de méthylation des histones⁵⁴. Nous sommes donc en présence d'un lien direct entre les activités enzymatiques responsables de deux mécanismes épigénétiques distincts.

L'épigénétique est donc un système régulateur fondamental, au-delà de l'information contenue dans la séquence d'ADN. Le gène défini par Mendel doit maintenant être considéré avec la chromatine qui l'entoure puisqu'elle joue un rôle primordial dans la régulation transcriptionnelle et que, de plus, elle est héréditaire tout comme les gènes mendéliens.

Système de transmission structurelle

La transmission structurelle est un mécanisme encore mystérieux. Il implique la transmission entre cellules (voire entre cellules de générations différentes) de structures particulières (par exemple de protéines). Ces structures modifiées semblent jouer le rôle de « patron » pour l'organisation structurelle de la génération suivante. Ce mécanisme de transmission a été mis en évidence dans les organismes unicellulaires ciliés comme la tetrahymena ou la paramécie. En effet, pour des cellules semblables au niveau génétique, on peut observer des différences dans l'organisation des cils de surface. Cette organisation est transmissible à la génération suivante⁵⁹. On soupçonne une telle transmission d'être également possible pour les organismes multicellulaires.

Implication et application

 

Pathologie

L'épigénétique aurait un rôle dans des maladies complexes⁶¹, mais étant un sujet d'étude récent, voire en plein boom, les études émettent majoritairement des conjectures sur des facteurs influant plus que des certitudes scientifiques sur d'éventuels rapports de cause à effet.

Causes et transmission héréditaire

« Trois voies de transmission sont possibles : la transmission héréditaire par les cellules germinales, ovocyte et spermatozoïdes, l'imprégnation in utero et la transmission par les interactions sociales²⁵. »

Il est question de caractéristiques de santé héritées d'un vécu des parents, par exemple l'influence du stress sur la taille des nouveau-nés⁶² ou de la faim pendant la gestation, sur la santé de la descendance (par exemple lors de la famine aux Pays-Bas en 1947^{N 3}). En 2002, deux études ont été publiées concernant les effets sur la descendance humaine de la nutrition. L'une sur l'effet des privations alimentaires entre 1890 et 1920 sur la descendance³⁷. L'autre sur une population dont étaient référencés tous les individus, ainsi que leur alimentation en fonction des récoltes, et qui a montré qu'une grand-mère ayant vécu une famine transmet cette information à sa descendance qui peut développer des maladies alors qu'elle n'a jamais connu de famine^{N 4}. En 2010, Frances Champagne met en corrélation la malnutrition, le stress et l'exposition aux produits toxiques de la mère avec l'état de santé des enfants, voire des petits enfants⁶³. De même, des études ont montré que les enfants de femmes enceintes durant les événements du 11 septembre 2001 possédaient un taux de cortisol plus élevé⁶⁴. On peut lire dans la même veine que « la mémoire traumatique de l’Holocauste se transmettrait génétiquement » avec la précision « Il s’agit de la première démonstration de transmission d’un traumatisme parental à son enfant, associé à des changements épigénétiques⁶⁵ ».

Ces phénomènes impliqueraient que certaines maladies ne sont pas dues à une variation de la séquence d’ADN mais peut-être à des « épimutations ». Par exemple, une anomalie épigénétique serait impliquée dans plus de la moitié des cas de syndrome de Silver-Russel⁶⁶.

Comportement et psychisme

Depuis 2010, des études lient des états mentaux et comportementaux à l'épigénétique par différentes voies.

• L'épigénétique a un impact sur les neurones, via une stabilisation de leurs connexions synaptiques, ce qui aurait un rôle sur la mémoire à long terme³⁹.
• Un stress infantile produit une sensibilité au stress à l'âge adulte, éventuellement transmissible à plusieurs générations suivantes, par son effet sur la méthylation de l'ADN des récepteurs au glucocorticoïde⁴⁰ (ex : traumatiser un souriceau mâle en le séparant régulièrement et imprévisiblement d’avec sa mère, et en stressant la mère modifiera le comportement de sa descendance sur quatre générations). La dépression adulte, à la suite d'une maltraitance quotidienne de 30 minutes chez la souris, est associée à un marquage épigénétique d'un facteur neurotrophique dérivé du cerveau⁶⁷. De même chez l'adolescent ou l'adulte humain, des expériences, des événements, un stress physique, sexuel, de deuil ou d'abandon - ou d'autres facteurs environnementaux génèrent la production d'étiquettes épigénétiques qui peuvent rester active durant toute la vie de l’individu. Cet effet du traumatisme se transmet d'une génération à l'autre via des modifications épigénétiques des cellules qui forment les spermatozoïdes et/ou les ovocytes. Les spermatozoïdes transmettent ce changement du programme génétique à la descendance et il est possible que les ovules fassent de même (phénomène moins étudié à ce jour).
• la mémorisation modifie elle-même l'expression de nos gènes⁶⁸ (par exemple le gène qui produit le BDNF (brain-derived neurotrophic factor), protéine impliquée dans la mémorisation spatiale et d'objets). La mémorisation implique le passage d'un signal électrique qui traverse des cellules neuronales en les transformant, ce qui peut conduire à une modification de la structure et forme du neurone, qui formera par exemple de nouvelles connexions. Ce processus implique l'action de plusieurs familles de protéines (enzymes, récepteurs, neurotransmetteurs…) synthétisées par le neurone dans son cytoplasme, autour du noyau, codées par de l'ARN messager à partir de l’information génétique contenue dans l'ADN cellulaire. On sait qu'un même gène peut produire des protéines différentes en s'exprimant différemment, grâce notamment à des étiquettes épigénétiques se fixant sur ou autour de l'ADN⁶⁸ ;

À partir des années 2010, des auteurs pensent qu'on pourrait bientôt « identifier des mécanismes épigénétiques impliqués dans le développement des maladies psychiatriques », proposer des modifications épigénétiques contrecarrant celles induites par un stress passé (qui semblent pouvoir être réversibles), et/ou trouver de « nouvelles cibles thérapeutiques »⁶⁹. Mais en 2012, d'autres auteurs rappellent que le statut de vérité scientifique du rôle de l'épigénétique dans les troubles mentaux est encore loin d'être atteint⁷⁰ et donc des "épimédicaments" soignant les conséquences de traumatismes (et/ou améliorant la mémoire ?). Selon Isabelle Mansuy, étant donné la complexité des altérations épigénétiques induites par le stress, un médicament unique semble illusoire.

D'autres auteurs font le lien entre pauvreté ou guerres et santé mentale, par différents vecteurs, avant de conclure : « Par conséquent, la priorité devrait être donnée aux politiques et programmes qui réduisent le stress parental, augmentent le bien-être émotionnel des parents et leur assurent des ressources matérielles suffisantes »⁷¹.

Cancer

« Des changements épigénétiques et des mutations génétiques sont présentes dans tous les types de cancers, mais leurs interactions sont si complexes qu’il est difficile de connaître les événements initiaux⁷². »

Le cancer est une prolifération de cellules toutes issues d'un même clone qui a acquis certaines caractéristiques lui permettant une résistance accrue et une capacité à se diviser indéfiniment. On peut donc l'envisager sous l'angle d'une maladie de l'expression des gènes. En effet, les mutations spontanées des gènes sont plutôt rares, les cellules humaines en culture présentent un taux de mutations spontanées de 2 × 10⁻⁷ mutations par gène par division cellulaire et l'on considère ainsi que d'autres mécanismes sont en cause pour expliquer l'apparition des cancers.

Plusieurs types de cancers sont associés à une réduction globale du taux de méthyl-cytosines dans le génome par rapport au tissu normal, alors qu'à l'inverse on observe parfois que certains gènes suppresseurs de tumeurs sont rendus silencieux par méthylation de novo de leur promoteur.

Des tumeurs peuvent maintenir stablement une mutation sur un allèle de gène alors que l'autre est hyperméthylé, et ainsi inactivé.

De plus, les gènes suppresseurs de tumeurs résident souvent au sein de régions caractérisées par des délétions fréquentes, aboutissant à une perte d’hétérozygotie (LOH).

Enfin, dans certaines de ces régions sont observés des événements épigénétiques sans altérations génétiques. Ces altérations épigénétiques (ex : méthylation de l'ADN et modifications des histones), semblent initier des processus qui résultent en une perte ou une activation de la transcription des gènes. Même une mutation peut être initialement due à un mécanisme épigénétique puisque, par exemple, une 5-méthyl-cytosine peut se désaminer (perte de la fonction amine) spontanément en thymine (autre base de l'ADN). Dans ce cas, la cause primaire est un phénomène épigénétique. On espère donc un jour pouvoir traiter certains cancers par des médicaments ciblant les modifications épigénétiques (moins fixes que les modifications génétiques, et parfois réversibles).

« Un essai a permis tout récemment d’observer l’effet positif d’un médicament qui supprime les modifications épigénétiques chez des personnes atteintes de cancers induits par des virus (cancers du col de l’utérus et certains cancers ORL dont ceux du nasopharynx). Les premiers résultats sont très encourageants⁷³. »

Prions

Les maladies infectieuses ne sont pas habituellement décrites comme des régulateurs épigénétiques, mais l'infection et la transmission verticale de virus fonctionnent de manière identique. De plus, certains prions ont montré des effets⁷⁴ bénéfiques et, comme ils décrivent la nature adaptative des protéines, ils ont été décrits comme des mécanismes de transmission épigénétique.

Agents pathogènes

Certaines bactéries pathogènes sont capables d'induire des changements épigénétiques dans les cellules qu'elles infectent. Par exemple Listeria monocytogenes provoque des modifications d'histones par le biais de nucléomodulines tandis que l'infection par Helicobacter pylori entraîne une hyperméthylation du génome des cellules concernées⁷⁵. Cette stratégie vise généralement à empêcher l'activation de gènes de la réponse immunitaire.

Thérapeutique

 

« Les variations épigénétiques sont finalement assez plastiques. Elles peuvent être effacées par des traitements chimiques, ce qui ouvre d'immenses perspectives thérapeutiques. Cet espoir s'est déjà concrétisé par le développement de premières « épidrogues » pour traiter certains cancers⁷⁶. »

Thérapies épigénétiques

La thérapie épigénétique (en) (appelée aussi épithérapie) agit sur l'expression des gènes, quand la thérapie génique consiste à changer les gènes.

La thérapie épigénétique peut consister néanmoins à agir directement sur l'ADN, sur la nature de ses constituants. C'est le cas d'une thérapie qui consiste à réactiver un gène silencieux en empêchant la méthylation de l'ADN en remplaçant un nucléotide normal (ici la cytosine), par un nucléotide qui ne peut être méthylé. Les analogues nucléosides ne pouvant être méthylés comme la 5-azacytidine sont incorporés lors de la réplication de l'ADN, ce qui semble montrer une efficacité dans le traitement de cancer du poumon⁷⁷, et des essais cliniques sont en cours pour traiter les syndromes myélodysplasiques et certaines leucémies, sièges d'une hyperméthylation génique⁷⁸.

Pour les cancers, les espoirs portent sur l'azacitidine, la décitabine, le panobinostat (en), la romidepsine, le belinostatle et le vorinostat…)⁷⁹.

Thérapies indirectement épigénétiques

Une intervention indirecte sur l'épigénome consiste à moduler la disponibilité des groupements méthyles. Pour ce faire, il est possible :

• de faire varier les concentrations de cofacteurs transportant les groupes méthyles (plus couramment la cobalamine — vitamine B12 — et l'acide folique^80,81, mais aussi la choline et la triméthylglycine, une bétaïne) ;
• d'intervenir sur les xénobiotiques et les autres facteurs reconnus pour avoir un impact sur la méthylation (ces traitements sont le plus souvent préventifs) ;
• de contrer le stress oxydatif, reconnu pour son impact négatif sur l'épigénome ;
• de réduire les concentrations d'homocystéine ;
• de moduler la disponibilité des groupes méthyles en intervenant sur leur incorporation dans les accepteurs de groupes méthyles autres que l'ADN, notamment les phospholipides des membranes cellulaires^82,83.

Il a été proposé que la vitamine B12, l'acide folique, l'ADH, ainsi que le stress oxydatif ont un rôle à jouer, via des modifications épigénétiques, dans les altérations de la neurogenèse observées chez les enfants prématurés⁸³.

Médicaments et drogues ayant des effets épigénétiques non thérapeutiques

Cette section doit être actualisée.
Des passages de cette section sont obsolètes ou annoncent des événements désormais passés. Améliorez-la ou discutez-en.

Certains médicaments et certaines drogues pourraient avoir des effets épigénétiques indésirés. Selon des hypotèses de 2009 et 2013, ces effets seraient fréquents⁸⁴. Par exemple, selon des modélisations informatiques, 5 % des médicaments connus pourraient agir avec l'histone désacétylase, qui n'est qu'un facteur de régulation épigénétique parmi d'autres⁸⁵. Parmi les médicaments et drogues ayant des effets épigénétiques indésirables, on peut mentionner certains des plus connus : le célécoxib, un anti-inflammatoire non stéroïdien, les antidépresseurs de classe ISRS (le citalopram, la fluoxétine⁸⁴) et tricyclique (l'imipramine⁸⁴), la tamoxifène, un régulateur des récepteurs de l'œstrogène utilisé dans le traitement du cancer du sein, l'acide valproïque, un médicament indiqué dans de nombreuses pathologies neurologiques, et, parmi les drogues, la cocaïne et les opiacés. La liste est encore incomplète⁸⁵. Voir aussi : Effet épigénétique des antidépresseurs.

Une étude suggère que les effets secondaires épigénétiques des médicaments peuvent être impliqués dans l'étiologie des maladies cardiaques, le cancer, les troubles neurologiques et cognitifs, l'obésité, le diabète, l'infertilité, et la dysfonction sexuelle⁸⁴. Les effets secondaires épigénétiques causés par un médicament, peuvent persister une fois le traitement arrêté selon certains auteurs⁸⁴, tandis pour d'autres, l'intérêt des thérapies épigénétiques repose au contraire sur la réversibilité de ces effets⁸⁶.

Le terme d'épigénétique en psychologie

Le psychologue Erik Erikson développa une Théorie épigénétique du développement humain traitant des crises psycho-sociales vécues par l'individu, servant ainsi à décrire différentes étapes développementales entrecoupées par ces crises⁸⁷. Selon lui, même si ces crises ont le plus souvent une origine génétique, la manière dont elles se vivent ne peut être expliquée par la génétique et donc, en écho à la théorie en biologie, sont qualifiées d'épigénétiques.

Notes et références

Notes

• L'épigénisation correspond à la transformation d'un minéral préexistant en un autre de même composition ; il s'agit souvent d'un changement dans la structure du minéral : par exemple, l'aragonite, contenue généralement dans des restes calcaires d'organismes, se transforme en calcite.
•  
• Par exemple : le noyau d'une cellule de peau d'amphibien transféré dans un œuf énucléé donne des animaux entiers (clones) ; un même génome peut donc avoir plusieurs destinées (l'ADN de la chenille et de son papillon est le même, et donc l'ADN seul ne nous informe guère sur la morphologie de l'individu) et sa détermination est réversible.
•  
• Idée notamment diffusée par le documentaire vidéo consultable en bas de page (Épigénétique, nous sommes ce que nous mangeons, 2008, relayé par un dossier dossier sur l'épigénétique [archive] de 2010
•  

Références

• (fr) C. Pieau, « Différenciation du sexe en fonction de la température chez les embryons d'Emys orbicularis L. (Chélonien) », Ann. Embryol. Morphog. n^o 7, 1974, p. 365-394.
•  
• « Edith Heard, au-delà des gènes » [archive], sur France Culture (consulté le 29 juillet 2020).
•  
• « Epigénétique » [archive], sur inserm.fr (consulté le 29 novembre 2017).
•  
• Dossier « Epigénétique » [archive], sur le site de l'INSERM, février 2015 (consulté le 3 septembre 2015).
•  
• Michel Morange, professeur de biologie à l'ENS, cité dans « L'épigénétique, l'hérédité au-delà de l'ADN » [archive], Le Monde, 22 avril 2013.
•  
• Émission « Une hérédité des caractères acquis ? » [archive], dans la série Sur les épaules de Darwin, France inter, 13 septembre 2014.
•  
• Présentation de l'épigénétique par Joël de Rosnay [archive] ; extrait vidéo tiré de la réunion des universités de la terre [archive] à l'UNESCO de 2011, intitulé « Bâtir une nouvelle société » [archive] (conférence complète [archive]).
•  
• L'existence de répresseurs et de dérépresseurs est connue depuis le XX^e siècle et explique pourquoi le même ADN fait de son organisme porteur des organismes aussi différents d'aspect que d'abord une chenille, puis, ensuite un papillon. Voir aussi Hsp90
•  
• Feinberg A.P (2018) « The key role of epigenetics in human disease prevention and mitigation »^{(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?)}. New England Journal of Medicine, 378(14), 1323-1334.
•  
• Vincent Colot, chercheur à l'ENS, cité dans « L'épigénétique, l'hérédité au-delà de l'ADN » [archive], Le Monde, 13 avril 2012.
•  
• (en) Kucharski R. et al., « Nutritional control of reproductive status in honeybees via DNA methylation. », Science, vol. 319,‎ 2008, p. 1827-1830 (PMID 18339900).
•  
• « Détermination du sexe par la température chez les reptiles »^{(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?)}, par Françoise Jauzein (INRP) et Claude Pieau (Institut Jacques-Monod).
•  
• Thomas Jenuwein (Research institute of molecular pathology, Vienne, Autriche) dans un entretien [archive] rapporté par Frédéric Mathieu en 2014 dans Les Valeurs de la vie. Lecture actualisée de l’œuvre de G. Canguilhem, le normal et le pathologique (1966) (ISBN 979-10-92895-03-2), p. 58 lire en ligne [archive].
•  
• Morgan TH, The theory of the Gene, New Haven, Yale University Press, 1926. (Source secondaire : Les Valeurs de la vie, Frédéric Mathieu 2014, p. 37.)
•  
• Humpherys D et al. (2001) (en) « Epigenetic instability in ES cells and cloned mice » [archive]. Science, 293(5527), 95-97.
•  
• Fraga, M. F., Ballestar, E., Paz, M. F., Ropero, S., Setien, F., Ballestar, M. L…. & Esteller, M. (2005) Epigenetic differences arise during the lifetime of monozygotic twins [archive]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102(30), 10604-10609.
•  
• (en) Présentation de l'objectif en 2010 [archive] et site du projet [archive]
•  
• (en) Grunstein M., Gasser S.M., « Epigenetics in Saccharomyces cerevisiae. », Cold Spring Harbor Perspectives in Biology, vol. 5, n^o 7,‎ 2013, a017491 (PMID 23818500).
•  
• (en) Sánchez-Romero M.A., Cota I., Casadesús J., « DNA methylation in bacteria: from the methyl group to the methylome », Current Opinion in Microbiology, vol. 25,‎ 2015, p. 9-16 (PMID 25818841).
•  
• Cubas P, Vincent C, Coen E. An epigenetic mutation responsible for natural variation in floral symmetry. Nature 1999, 401:157-61.
•  
• Roger Arnaldez et René Taton, La science antique et médiévale. Des origines à 1450, Presses universitaires de France, 1994, p. 277.
•  
• Antoine Danchin, L'œuf et la poule. Histoires du code génétique, Fayard, 1983, p. 11.
•  
• Scott F. Gilbert, Biologie du développement, De Boeck Supérieur, 2004, p. 6.
•  
• Michel Gaudichon, L'homme, témoin de la créativité du vivant, L'Harmattan, 2011, p. 34.
•  
• François Gonon et Marie-pierre Moisan, L’épigénétique, la nouvelle biologie de l’histoire individuelle ? p. 21, Revue française des affaires sociales 2013/1-2 (n^o 1-2)
•  
• Remy J.J. (2010), Stable inheritance of an acquired behavior in Caenorhabditis elegans. Current Biology , 20:R877-8.
•  
• Greer E, Maures T, Ucar D, et coll. Transgenerational epigenetic inheritance of longevity in Caenorhabditis elegans. Nature 2011, 479:365-71.
•  
• Morange M. La tentative de Nikolai Koltzoff (Koltsov) de lier génétique, embryologie et chimie physique, J. Biosciences. 2011. V. 36. P. 211-214
•  
• Waddington C. H. 1942. Canalization of development and the inheritance of acquired characters. Nature 150:563–565.
•  
• (en) Prix Nobel de physiologie et médecine 1965. [archive]
•  
• (en) Prix Nobel de physiologie et médecine 1975. [archive]
•  
• Morange M (2002), The relations between genetics and epigenetics: a historical point of view. Ann NY Acad Sci 2002; 981: 50-60.
•  
• Claudine Junien et al. (2005), Epigénomique nutritionnelle du syndrome métabolique [archive], Médecine/Sciences 2005, 21, 396-404
•  
• Michel Morange (2005), Quelle place pour l’épigénétique ? [archive] Médecine/Sciences 2005, 21:367-9.
•  
• François Képès (2005), L’épigénétique comme aspect de la post-génomique [archive] (222,5 ko) M/S 2005, 21, 371-76.
•  
• « Le darwinisme évolue aussi » [archive] dans La Recherche (2006).
•  
• « Petite histoire de l'épigénétique » [archive] sur nationalgeographic.fr.
•  
• Daxinger L., Whitelaw E. (2012), « Understanding Transgenerational Epigenetic Inheritance via the Gametes in Mammals », Nat Rev Genet, n^o 13, p. 153-162.
•  
• (en) Day J.-J., Sweatt J.-D. (2011), « Epigenetic Mechanisms in Cognition », Neuron, n^o 70, p. 813-829. (en ligne [archive]
•  
• (en) Tyrka A.-R., Price L.-H., Marsit C. et al. (2012), « Childhood Adversity and Epigenetic Modulation of the Leukocyte Glucocorticoid Receptor: Preliminary Findings in Healthy Adults », PLoS One, n^o 7, p. e30148. (en ligne [archive])
•  
• Darwin a exposé son « hypothèse de la pangenèse » en 1868 dans De la variation des animaux et des plantes sous l'action de la domestication [archive].
•  
• Portrait la même année par Julia Margaret Cameron.
•  
• Vincent Colot Une transmission épigénétique de caractères complexes [archive] article pour la science, 02/2014, Yvan Pandelé
•  
• Dias B, Ressler K. Parental olfactory experience influences behavior and neural structure in subsequent generations. Nature Neuroscience 2014, 17:89-96.
•  
• Gapp K, Jawaid A, Sarkies P, et coll. Implication of sperm RNAs in transgenerational inheritance of the effects of early trauma in mice. Nature Neuroscience 2014, 17:667-9
•  
• Radford E, Ito M, Shi H, et coll. In utero undernourishment perturbs the adult sperm methylome and intergenerational metabolism. Science 15 August 2014, 345:1-8.
•  
• Carone B, Fauquier L, Habib N, et coll. Paternally-induced transgenerational environmental reprogramming of metabolic gene expression in mammals. Cell 2010, 143:1084-1096.
•  
• McBirney M, King SE, Pappalardo M, Houser E, Unkefer M, Nilsson E, Sadler-Riggleman I, Beck D, Winchester P, Skinner MK (2017) "Atrazine induced epigenetic transgenerational inheritance of disease, lean phenotype and sperm epimutation pathology biomarkers". PLoS ONE. 2017 Sep 20; 12(9): e0184306|résumé [archive]
•  
• Shnorhavorian M, Schwartz SM, Stansfeld B, Sadler-Riggleman I, Beck D, Skinner MK. (2017), Differential DNA Methylation Regions in Adult Human Sperm following Adolescent Chemotherapy: Potential for Epigenetic Inheritance|PLoS ONE. 1^er février ; 12(2): e0170085
•  
• (en) Stephen T. Crews et Joseph C. Pearson, « Transcriptional autoregulation in development », Current biology : CB, vol. 19, n^o 6,‎ 24 mars 2009, R241–R246 (ISSN 0960-9822, PMID 19321138, PMCID 2718735, DOI 10.1016/j.cub.2009.01.015, lire en ligne [archive], consulté le 22 juillet 2019).
•  
• (en) Mark Ptashne, « Epigenetics: core misconcept », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 110, n^o 18,‎ 30 avril 2013, p. 7101–7103 (ISSN 1091-6490, PMID 23584020, PMCID 3645541, DOI 10.1073/pnas.1305399110, lire en ligne [archive], consulté le 23 juillet 2019).
•  
• (en) Jung-Shin Lee, Edwin Smith et Ali Shilatifard, « The Language of Histone Crosstalk », Cell, vol. 142, n^o 5,‎ 3 septembre 2010, p. 682–685 (ISSN 0092-8674, PMID 20813257, PMCID 3711869, DOI 10.1016/j.cell.2010.08.011, lire en ligne [archive], consulté le 30 juillet 2019).
•  
• (en) Mark Ptashne, « On the use of the word ‘epigenetic’ », Current Biology, vol. 17, n^o 7,‎ avril 2007, R233–R236 (DOI 10.1016/j.cub.2007.02.030, lire en ligne [archive], consulté le 29 juillet 2019).
•  
• (en) Seisenberger S, Peat JR, Reik W., « Conceptual links between DNA methylation reprogramming in the early embryo and primordial germ cells. », Curr Opin Cell Biol, vol. 25, n^o 3,‎ 2013, p. 281-8 (PMID 23510682, DOI 10.1016/j.ceb.2013.02.013, lire en ligne [archive]).
•  
• Anna M. Kietrys & Eric T. Kool (2016) Epigenetics: A new methyl mark on messengers; Nature 530, 423–424 (25 Fév 2016) ; doi:10.1038/530423a, publié en ligne 24 fév 2016 (résumé [archive])
•  
• « Qu'est-ce que l'épigénétique ? » [archive], Le Journal de la santé.
•  
• (en) Bartolomei MS. et Ferguson-Smith AC., « Mammalian genomic imprinting. », Cold Spring Harbor Perspectives in Biology, vol. 3(7),‎ 2011 (PMID 21576252).
•  
• (en) Cowley M., Oakey RJ., « Retrotransposition and genomic imprinting. », Briefings in Functional Genomics, vol. 9(4),‎ 2010, p. 340-346 (PMID 20591835).
•  
• (en) Beisson J., Sonneborn TM., « Cytoplasmic Inheritance of the Organization of the Cell Cortex in Paramecium aurelia. », PNAS, vol. 53(2),‎ 1965, p. 275-282 (PMID 14294056).
•  
• Vulgarisé à la 25^e minute du lien audio précédent, cette étude est présentée dans la publication suivante : Gapp K, Jawaid A, Sarkies P, et coll. Implication of sperm RNAs in transgenerational inheritance of the effects of early trauma in mice. Nature Neuroscience 2014, 17:667-9.
•  
• Voir sur orbi.ulg.ac.be. [archive]
•  
• Rapport d'activité de l'unité Biologie Cellulaire du Noyau [archive], [PDF] « Yves Combarnous, Les hormones »^{(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?)} (consulté le 8 avril 2013).
•  
• Champagne F.-A. (2010), « Epigenetic Influence of Social Experiences Across the Lifespan », Developmental Psychobiology, n° 52, p. 299-311.(Voir en ligne [archive])
•  
• Selon des recherches de Gerard Essed et Rachel Yehuda, voir respectivement Le stress rend les nouveau-nés plus petits [archive] et Après le choc [archive]
•  
• Le traumatisme de la Shoah est-il héréditaire ? [archive] (source de l'étude [archive]), ((en)source secondaire [archive] plus développé anglophone)
•  
• Inserm (2005), Syndrome de Silver-Russel : une anomalie épigénétique en cause dans plus de 50 % des cas [archive] (2 septembre 2005) (31,8 ko)
•  
• Roth T.-L., Sweatt J.-D. (2011), « Epigenetic Marking of the bdnf Gene by Early-Life Adverse Experiences », Horm Behav, n^o 59, p. 315-320. (en ligne [archive])
•  
• Sander Eléna (2019) La mémoire modifie l’expression de nos gènes  [archive] ; Interview d'Isabelle Mansuy, directrice du laboratoire de neuro-épigénétique à l'Institut des neurosciences de l'Université de Zurich (Suisse), Science et Avenir ; publié le 20.04.2019
•  
• Bale T.-L., Baram T.-Z., Brown A.-S. et al. (2010), « Early Life Programming and Neurodevelopmental Disorders », Biol Psychiatry, n° 68, p. 314-319. (Lien internet [archive])
•  
• Gavin D.-P., Akbarian S. (2012), « Epigenetic and Post-Transcriptional Dysregulation of Gene Expression in Schizophrenia and Related Disease », Neurobiol Dis, n° 46, p. 255-262.(voir en ligne [archive])
•  
• Hackman D.-A., Farah M.-J., Meaney M.-J. (2010), « Socioeconomic Status and the Brain: Mechanistic Insights from Human and Animal Research », Nat Rev Neurosci, n° 11, p. 651-659. (lien Internet [archive])
•  
• Zdenko Herceg, cancérologue du Centre international de recherche sur le cancer (Lyon) (source). [archive]
•  
• [1] [archive] Dr Christophe Le Tourneau, chef de l’unité des Essais précoces à l’Institut Curie dans le journal de l'institut Curie le 4 septembre 2015.
•  
• Exemple : Inhibition épigénétique relative de la réplication du prion par la biosynthèse in situ [archive] de l'hypodermine du Hypoderme (insecte)
•  
• (en) Bierne H, Hamon M, Cossart P, « Epigenetics and bacterial infections », Cold Spring Harb Perspect Med.,‎ 2012 (PMID 23209181, DOI 10.1101/cshperspect.a010272, lire en ligne [archive]).
•  
• Edith Heard cité par Le Monde (source [archive]).
•  
• ARC - Juergens et coll., « Cancer Discovery », décembre 2011 (présenté à la conférence internationale « Molecular targets and cancer therapeutic », novemebre 2011, San Francisco. (source secondaire [archive])
•  
• (en) Grövdal M. et coll., « Maintenance treatment with azacytidine for patients with high-risk myelodysplastic syndromes (MDS) or acute myeloid leukaemia following MDS in complete remission after induction chemotherapy. », British Journal of Haematology, vol. 150,‎ 2010, p. 293-302 (PMID 20497178).
•  
• Cécile Klingler, « Les promesses des épimédicaments contre les cancers », La Recherche, n^o 548,‎ 2019, p. 39.
•  
• (en) Ciappio ED, Liu Z, Brooks RS, Mason JB, Bronson RT, Crott JW, « Maternal B vitamin supplementation from preconception through weaning suppresses intestinal tumorigenesis in Apc1638N mouse offspring. », Gut,‎ 2011 (PMID 21659408, DOI 10.1136/gut.2011.240291, lire en ligne [archive]).
•  
• (en) McKay JA, Wong YK, Relton CL, Ford D, Mathers JC, « Maternal folate supply and sex influence gene-specific DNA methylation in the fetal gut. », Mol Nutr Food Res,‎ 2011 (PMID 21770049, DOI 10.1002/mnfr.201100150).
•  
• La disponibilité de l'acide gras oméga-3 ADH conditionne à son tour les concentrations des divers phospholipides
•  
• (en) Dhobale M, Joshi S, « Altered maternal micronutrients (folic acid, vitamin B(12)) and omega 3 fatty acids through oxidative stress may reduce neurotrophic factors in preterm pregnancy », J Matern Fetal Neonatal Med,‎ 2011 (PMID 21609203, DOI 10.3109/14767058.2011.579209).
•  
• (en) Csoka AB, Szyf M., « Epigenetic side-effects of common pharmaceuticals: a potential new field in medicine and pharmacology. », Med Hypotheses., n^o 73(5):770-80,‎ novembre 2009 (lire en ligne [archive])
  

  « SSRI antidepressants have been shown to cause long-term alterations in gene expression, presumably resulting from chronic elevation of serotonin (5-HT) neurotransmission in the brain. Imipramine, a tricyclic antidepressant can also affect chromatin remodeling and gene expression. […] We propose that epigenetic side-effects of pharmaceuticals may be involved in the etiology of heart disease, cancer, neurological and cognitive disorders, obesity, diabetes, infertility, and sexual dysfunction. […] Any epigenetic side-effect caused by a drug may persist after the drug is discontinued. »

•  
• (en) J. Lötsch, G. Schneider, D. Reker, MJ. Parnham, P. Schneider, G. Geisslinger et A. Doehring, « Common non-epigenetic drugs as epigenetic modulators », Trends Mol Med, vol. 19, n^o 12,‎ décembre 2013, p. 742-53 (PMID 24054876, DOI 10.1016/j.molmed.2013.08.006).
•  
• (en) Nita Ahuja, Anup R. Sharma et Stephen B. Baylin, « Epigenetic Therapeutics: A New Weapon in the War Against Cancer », Annual review of medicine, vol. 67,‎ 2016, p. 73–89 (ISSN 0066-4219, PMID 26768237, PMCID 4937439, DOI 10.1146/annurev-med-111314-035900, lire en ligne [archive], consulté le 20 janvier 2021).
•  

Voir aussi

Il existe une catégorie consacrée à ce sujet : Épigénétique.

 

Bibliographie

• Pierre-Paul Grassé :
  • 1973 : L'évolution du vivant, matériaux pour une nouvelle théorie transformiste, Albin Michel (Paris) : 477 p.
  • 1978 : Biologie moléculaire, mutagenèse et évolution, Masson (Paris) : 117 p. (ISBN 2-225-49203-4)
• Andras Paldi, L’épigénétique est-elle lamarckienne ? [archive], conférence à l’École normale supérieure du 29 juin 2009.
• Edith Heard, Épigénétique et mémoire cellulaire, Fayard, 2013
• (en) Roberto Bonasio, Shengjiang Tu et Danny Reinberg, « Molecular Signals of Epigenetic States », Science,‎ 2010 (PMCID PMC3772643, lire en ligne [archive])
• (en) Jörg Tost, Epigenetics, Horizon Scientific Press, 2008
• (en) Richard C. Francis, Epigenetics. How Environment Shapes Our Genes, W. W. Norton & Company, 2011
• (en) Trygve Tollefsbol, Handbook of Epigenetics. The New Molecular and Medical Genetics, Academic Press, 2010

Articles connexes

Liens externes

• Ressources relatives à la santé

•  :
  • (no + nn + nb) Store medisinske leksikon [archive]
  • (cs + sk) WikiSkripta [archive]
• Notices dans des dictionnaires ou encyclopédies généralistes
•  :

  • Encyclopædia Britannica [archive]
  • Encyclopædia Universalis [archive]
• Notices d'autorité

•  :

  • Bibliothèque du Congrès
  • Gemeinsame Normdatei
  • Bibliothèque nationale de la Diète
  • Bibliothèque nationale d’Israël
• Épigénome [archive] le site européen sur la recherche en épigénétique
• Quand l'environnement module l’expression des gènes [archive]
• Documentaire TERRANOA: « La vie cachée de nos gènes » [archive]
• Page « épigénétique » [archive] de l'INSERM
• Qu'est-ce que l'épigénétique ? [archive]
• La première carte de l'épigénome humain révèle les secrets de l'ADN [archive]
• Unité7216 Épigénétique et Destin Cellulaire: groupe de recherche ARNs non codants [archive] animé par Claire Rougeulle

Médias

• « Epimédicaments : y’a pas que l’ADN dans la vie » [archive], La Méthode scientifique, France Culture, 13 janvier 2021
• Audio : Une hérédité des caractères acquis? [archive], présentation de l'épigénétique par Jean-Claude Ameisen sur France inter, dans son émission Sur les épaules de Darwin du samedi 13 septembre 2014
• Vidéo : Épigénétique, nous sommes ce que nous mangeons, documentaire de 2008 de Frank Papenbroock et Peter Moers (diffusé sur Arte en 2009). Voir en ligne : 1/3 [archive], 2/3 [archive] et 3/3 [archive]
• Vidéo : Un fantôme dans nos gènes, documentaire de 2005 de Nigel Paterson (diffusé sur Arte le 6 juin 2009) page Arte [archive]
• Livre : Nicolas Beuglet, L'Île du diable : roman, Paris/53-Mayenne, X0 Edition, 2019, 313 p. (ISBN 978-2-37448-134-0 et 2-37448-134-4, OCLC 1122801940, lire en ligne [archive])

[masquer] v · m Expression des gènes
Introduction à la génétique	Théorie fondamentale de la biologie moléculaire · ADN · ARN · ARNm · Protéine · Code génétique · Biosynthèse des protéines
Transcription	Régulation de la transcription Facteurs de transcription · ARN polymérase · Promoteur · Amplificateur · Inactivateur · Site d'initiation de la transcription · Atténuation transcriptionnelle Régulation post-transcriptionnelle Modifications post-transcriptionnelles · Édition · Épissage · Épissage alternatif · Polyadénylation · Dégradation des ARNm non-sens · Interférence par ARN · Micro-ARN
Traduction	Régulation de la traduction Facteurs d'initiation · PABP · Ribosome · ARNt · IRES · Coiffe Régulation post-traductionnelle Modifications post-traductionnelles (ajout de groupe fonctionnels, peptidiques, modifications structurelles ou chimiques ; par exemple : phosphorylation) · Protéolyse
Contrôle épigénétique	Extinction de gène · CRISPRoff et CRISPRon · Méthylation de l'ADN · Code des Histones · Gène Hox · Gène soumis à empreinte

• Portail de la biologie cellulaire et moléculaire
• Portail origine et évolution du vivant
• Portail de l’histoire de la zoologie et de la botanique
• Portail de la médecine

Catégories :

• Épigénétique
• Code génétique

[+]